68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002819 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002819  flagellar protein FliJ  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03158  flagellar biosynthesis chaperone  89.12 
 
 
147 aa  270  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1713  flagellar biosynthesis chaperone  67.83 
 
 
147 aa  214  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2304  flagellar biosynthesis chaperone  65.52 
 
 
145 aa  203  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1346  flagellar export protein FliJ  35.11 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.267167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3064  flagellar export protein FliJ  33.1 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543016  normal  0.584874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3224  flagellar protein FliJ  35.38 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2932  flagellar export protein FliJ  33.1 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2922  flagellar export protein FliJ  33.1 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1441  flagellar export protein FliJ  33.1 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.707873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1353  flagellar export protein FliJ  34.62 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189316  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1622  flagellar export protein FliJ  33.79 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1286  flagellar export protein FliJ  34.38 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2572  flagellar export protein FliJ  33.85 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2293  flagellar protein FliJ  30.28 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.919883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1370  flagellar export protein FliJ  35.2 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1186  flagellar export protein FliJ  33.59 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1365  flagellar export protein FliJ  29.93 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3062  flagellar export protein FliJ  29.58 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1328  flagellar export FliJ  29.66 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.843025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  28.91 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1506  flagellar protein FliJ  30.71 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02885  Flagellar biosynthesis chaperone  31.19 
 
 
148 aa  57.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0337706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  28.26 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  31.96 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  23.31 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  35.29 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  24.29 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  24.29 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  24.29 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  24.29 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  24.29 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  24.29 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  24.29 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  26.52 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  27.74 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3043  flagellar export protein FliJ  27.03 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  35.29 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  25.76 
 
 
150 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  23.57 
 
 
150 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  29.13 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1349  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.21 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3690  flagellar biosynthesis chaperone  29.13 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  25.36 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  25.71 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  27.5 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  28.16 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  28.16 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  21.43 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  21.43 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3065  flagellar export protein FliJ  22.14 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  21.43 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  22.86 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2951  flagellar biosynthesis chaperone  25.19 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  22.63 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  22.3 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6417  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  20.71 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2979  flagellar export protein FliJ  22.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3113  flagellar export protein FliJ  22.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  21.43 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1544  flagellar export protein FliJ  23.45 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2355  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  26.77 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2579  flagellar biosynthesis chaperone  27.13 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5265  flagellar export protein FliJ  21.01 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206275 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4727  flagellar export protein FliJ  20.71 
 
 
154 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3650  flagellar export protein FliJ  20.71 
 
 
154 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.842267  normal  0.866565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0017  response regulator receiver domain-containing protein  27.86 
 
 
333 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1993  flagellar export protein FliJ  25.18 
 
 
147 aa  40.8  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>