179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000176 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000176  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.444821  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.49 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
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NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.8 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9065  hypothetical protein  44.21 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1912  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.05 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  40.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.42 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0333  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.05 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_2095  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.11 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.84 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  39.8 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  36 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473848 
 
 
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NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  35 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_0036  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.95 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
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NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.32 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
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NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.02 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.67 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal  1 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.65 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
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NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.54 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.496256 
 
 
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NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  35 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.08 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.832839 
 
 
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NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.3 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
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NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
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NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.99 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.99 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.234612 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  35 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  35.35 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.29 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_00920  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  36.36 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  38.14 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.36 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
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NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
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NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.11 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1752  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  30 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.65 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
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NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.32 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.68 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3194  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.85 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1337  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.05 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0544712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.74 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.11 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.05 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299279 
 
 
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NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  35.05 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.65 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
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NC_009486  Tpet_1695  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.08 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.158943  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1797  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.66 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  34.69 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3115  divalent cation tolerance protein  35.11 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0820083  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.31 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.32 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.32 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.32 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.31 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0828  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.3 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1473  periplasmic divalent cation tolerance protein  34.02 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000113096  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.31 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.78 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.65 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  34.34 
 
 		 580 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.31 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
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NC_011883  Ddes_0199  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.31 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  32.32 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_2261  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.63 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155745  normal  0.159586 
 
 
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NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.32 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
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NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  33.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014248  Aazo_5019  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.29 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71595  n/a   
 
 
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NC_010085  Nmar_0108  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.59 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000262572 
 
 
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NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  30.53 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  30.61 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1899  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.58 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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