291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1924 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 328 aa  672    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  74.54 
 
 		 326 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  72.09 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  64.6 
 
 		 322 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  53.71 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  53.71 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  53.71 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  53.71 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  53.71 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  54.06 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  54.06 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  54.06 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  54.06 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  54.06 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  54.06 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  54.06 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  54.06 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  53.71 
 
 		 322 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  52.3 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  53.38 
 
 		 325 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  53.74 
 
 		 326 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  53.74 
 
 		 326 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  53.38 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  52.67 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  50.7 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  50.35 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  56.13 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  51.6 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  60.54 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  62.15 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  55.36 
 
 		 369 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  57.58 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  55.45 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  55.45 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  55.94 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  55.94 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  55.94 
 
 		 335 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  51.57 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  52.65 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  54.73 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  51.54 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  53.7 
 
 		 348 aa  225  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  53.73 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  59.14 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  53.73 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  53.96 
 
 		 316 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  44.64 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  48.44 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  51.71 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 		 398 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  48.78 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 		 413 aa  198  9e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  49.02 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  48.78 
 
 		 406 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 		 429 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  47.06 
 
 		 410 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  45.73 
 
 		 418 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  45.73 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  47.73 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  42.74 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  51.56 
 
 		 419 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  44.14 
 
 		 276 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.73 
 
 		 429 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  48.86 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  49.24 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  45.3 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  47.8 
 
 		 404 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  47.14 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  40.88 
 
 		 405 aa  188  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  46.67 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  46.82 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  48.78 
 
 		 415 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  46.51 
 
 		 411 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  48.78 
 
 		 404 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  44.87 
 
 		 404 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  47.95 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  47.95 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  47.95 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.19 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.49 
 
 		 281 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  50.28 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  46.58 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  46.46 
 
 		 405 aa  185  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  50.73 
 
 		 419 aa  185  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  44.07 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.21 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  44.21 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.66 
 
 		 302 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  44.64 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  45.66 
 
 		 281 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  45.66 
 
 		 281 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>