91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1550 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  79.52 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  78.84 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  63 
 
 		 316 aa  351  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.5 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.5 
 
 		 287 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.84 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.84 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.83 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  48.84 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.9 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.74 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.56 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  34.11 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.21 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  31.19 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  31.27 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.02 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.34 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  33.11 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.46 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.96 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.56 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.93 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.06 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.27 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  31.58 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.11 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  29.94 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  29.28 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  29.28 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  29.28 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  29.28 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.53 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.53 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.45 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.53 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.53 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  28.97 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  28.04 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  27.41 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.35 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.05 
 
 		 344 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  27.91 
 
 		 344 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.22 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.29 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  30.48 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  29.37 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  29.91 
 
 		 204 aa  85.5  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.1 
 
 		 340 aa  85.5  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.67 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.26 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  27.02 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.57 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.48 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.37 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.04 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.32 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.4 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  30.4 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.23 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.46 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.46 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.95 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.69 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  30.33 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.77 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.96 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.55 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.11 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  22.7 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.6 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  22.7 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.71 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  21.74 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.9 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.2 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  24.68 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.01 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  24.38 
 
 		 233 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.27 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.08 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  23.74 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  23.08 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.52 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.21 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  20.9 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  21.88 
 
 		 212 aa  42.7  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>