97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1530 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1530  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  872    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0143  hypothetical protein  28.15 
 
 		 395 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184746  normal  0.13553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  30.03 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  31.34 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3961  hypothetical protein  32.3 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1967  hypothetical protein  28.92 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  32.96 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  32.68 
 
 		 399 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  32.21 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  29.89 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  31.73 
 
 		 411 aa  93.2  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3149  hypothetical protein  27.25 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.717167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2399  hypothetical protein  25.68 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  29.89 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  27.65 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  27.37 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  28.32 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  27.89 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  28.86 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  27.11 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  25.79 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  28.19 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  27.59 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  27.03 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4172  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  26.29 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3844  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  26.36 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  25.61 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  25.61 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  23.93 
 
 		 374 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  25.61 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  27.15 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  26.18 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  27.04 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  29.82 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  29.82 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  28.4 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  29.82 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  29.82 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  29.82 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  29.82 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  29.82 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  24.77 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  25.38 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  32.41 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  26.84 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  23.93 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1649  putative opgC protein  26.28 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0845152  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1706  opgC protein, putative  26.28 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  29.52 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  23.24 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  24.41 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  24.41 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  24.41 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  24.41 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4185  hypothetical protein  27.91 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  24.41 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  24.41 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  24.41 
 
 		 450 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  28.38 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  28.38 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  25.44 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  26.67 
 
 		 681 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2238  OpgC protein, putative  23.98 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  27.68 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1209  OpgC protein  26.21 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  22.97 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  28.03 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3921  hypothetical protein  26.39 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0154  hypothetical protein  27.07 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  25.92 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  27.16 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  28.12 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  30.4 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  25 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  27.69 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  26.99 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3642  hypothetical protein  28.15 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  25.35 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  27.61 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  27.59 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  29.15 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  29.15 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  29.15 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6048  hypothetical protein  24.89 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983197  normal  0.374141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  29.72 
 
 		 375 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4496  hypothetical protein  27.92 
 
 		 367 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4038  hypothetical protein  27.72 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  25.86 
 
 		 388 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  25.14 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  29.31 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  28.44 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3465  hypothetical protein  31.76 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604718  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  22.54 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1533  hypothetical protein  28.32 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0930  OpgC protein  24.58 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0208  hypothetical protein  28.06 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.66956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2375  OpgC protein  24.42 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0332803  decreased coverage  0.00013342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>