More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0963 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0963  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 379 aa  736    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0211536  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000423  multidrug resistance protein D  66.39 
 
 		 378 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.575568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3307  multidrug resistance protein D  59.89 
 
 		 381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.635246  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3551  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56.34 
 
 		 379 aa  348  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3276  multidrug resistance protein D  56.13 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3485  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  48.02 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.83 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.87 
 
 		 389 aa  325  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  48.3 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.56 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.06 
 
 		 387 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.51 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0579  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  51.48 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04859  hypothetical protein  42.55 
 
 		 434 aa  288  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1082  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.79 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.51 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.51 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.22 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.68 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.22 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  37.64 
 
 		 399 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  37.93 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2693  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.693922  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.93 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4263  MFS family transporter  36.97 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0514386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50050  MFS family transporter  36.55 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.012942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.07 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3477  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50 
 
 		 126 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.26 
 
 		 457 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.38 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  26.36 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.35 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.09 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.06 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  31.58 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  28.65 
 
 		 401 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  31.61 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.49 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.79 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.79 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.59 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 411 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  28.28 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.89 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.89 
 
 		 458 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.89 
 
 		 405 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.89 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.19 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.11 
 
 		 268 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122964  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.28 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  28.12 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.6 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.66 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  27.76 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  28.62 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.62 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.49 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.57 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.84 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.52 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.62 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  26.39 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.44 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  25.48 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.33 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  28.11 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.28 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  28.36 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.53 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.63 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.08 
 
 		 452 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.93 
 
 		 409 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.31 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  25.99 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.76 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.62 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.82 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.15 
 
 		 411 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  27.61 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.31 
 
 		 409 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.39 
 
 		 402 aa  97.1  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.21 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.63 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.09 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.49 
 
 		 437 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  25.29 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.69 
 
 		 401 aa  96.3  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  24.59 
 
 		 423 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
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NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  27.02 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.12 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.24 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.5 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.24 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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