35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1551 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 342 aa  677    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  36.83 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  27.37 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  21.49 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  23.72 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  23.34 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  23.12 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  29.66 
 
 		 248 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  24.71 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  25.71 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 249 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  22.01 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  21.43 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  21.43 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  22.5 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  21.31 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  21.43 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  21.43 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  21.43 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  21.43 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  21.43 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  21.31 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  21.43 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  21.49 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  23.46 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  21.47 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  24.08 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 233 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>