41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1288 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  36.95 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  38.31 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  35 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  34.73 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  32.17 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  35.54 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  33.74 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.4 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  33.74 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  33.93 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  29.44 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  30.86 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  25.41 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  31.55 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  31.1 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  29.05 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  25.88 
 
 		 474 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  28.81 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  30.36 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  26.96 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  26.73 
 
 		 597 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  28.91 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  24.67 
 
 		 622 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  28.5 
 
 		 594 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  26.7 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1291  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  24.43 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.8 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.98 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  23.77 
 
 		 272 aa  49.3  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  23.99 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.58 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  25.11 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  25.27 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1228  protein of unknown function DUF324  34.21 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2589  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  33.65 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.598353  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  24.49 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  26.58 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  24.06 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>