83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0033 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 72 bp  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  93.65 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  97.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2892  tRNA-Asn  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000182855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2891  tRNA-Asn  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000194238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2890  tRNA-Asn  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000200194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2889  tRNA-Asn  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000182855  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000000806008  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t39  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000300165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0048  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000334788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.360005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0118555  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0021  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0370611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0050  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0006  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.242548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0053  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0055  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0077  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0079  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000505976  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0025  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0132598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0174  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0415  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0379576  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>