More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1696 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 		 469 aa  939    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  55.77 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  52.9 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  52.16 
 
 		 459 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  53 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  51.61 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  51.61 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  51.61 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  53.94 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  52.15 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  51.19 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.21 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.21 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.74 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  47 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  45.55 
 
 		 475 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  43.84 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  44.26 
 
 		 467 aa  362  9e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.77 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.64 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 		 475 aa  252  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  34.09 
 
 		 484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.09 
 
 		 458 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.03 
 
 		 459 aa  229  7e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.78 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  32.08 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  32.08 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.2 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  31.87 
 
 		 459 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  33.26 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  33.84 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  30.87 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.44 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  31.29 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  31 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  31.45 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  32.92 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  31.95 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  31.85 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  32 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  32.99 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  32.56 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  31.79 
 
 		 590 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.33 
 
 		 456 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  31.72 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  31.79 
 
 		 459 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  31.3 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  32.6 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  30.79 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  30.4 
 
 		 459 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  30.4 
 
 		 459 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.31 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  31.67 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.69 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  30.04 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  30.89 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.33 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.97 
 
 		 466 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  31.67 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  30.24 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  31.86 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.02 
 
 		 468 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.23 
 
 		 452 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 		 477 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  29.82 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  32.27 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.76 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  31.14 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  30.7 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  33.72 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.19 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  31.14 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.16 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.6 
 
 		 466 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  30.26 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  30.42 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  30.7 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  31.95 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  30.91 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  31.95 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  31.95 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  31.95 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  31.95 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  31.8 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  31.95 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  31.13 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  30.48 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.57 
 
 		 463 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1957  NADPH-glutathione reductase  30.77 
 
 		 451 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168279 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  33.17 
 
 		 550 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  30.7 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>