More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1236 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 362 aa  732    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  77.84 
 
 		 357 aa  554  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  77.84 
 
 		 357 aa  554  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  77.84 
 
 		 357 aa  554  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  74.36 
 
 		 357 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  76.39 
 
 		 357 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  81.03 
 
 		 357 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  77.93 
 
 		 364 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  69.23 
 
 		 354 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  66.3 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  66.86 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  67.53 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  62.61 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  63.17 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  63.17 
 
 		 350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  63.64 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  61.58 
 
 		 357 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  63.32 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  63.82 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  62.32 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 357 aa  421  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  63.31 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  63.85 
 
 		 364 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  60.7 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  64.26 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  64.26 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  61.5 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  63.93 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  59.78 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  52.87 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  64.12 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  60.73 
 
 		 355 aa  360  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 357 aa  338  8e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  47.8 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  48.99 
 
 		 357 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 357 aa  326  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  52.62 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  46.37 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  46.59 
 
 		 358 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  52 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  47.53 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  46.31 
 
 		 355 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  322  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  46.7 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 		 360 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  46.09 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.92 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0523  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 359 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  46.84 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 355 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  45.24 
 
 		 356 aa  316  5e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  44.69 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  47.66 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  48.16 
 
 		 356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  47.41 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  45.38 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  45.24 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 357 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>