83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0540 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0220  GCN5-related N-acetyltransferase  48.47 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0394642  hitchhiker  0.00447894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.410828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
318 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
296 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.76 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2558  hypothetical protein  35.37 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0371121  normal  0.114182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2311  acetyltransferase  25.52 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0713  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 
172 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.853775  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1904  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607979  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1712  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  26.53 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2111  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0586754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  27.14 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1518  GNAT family acetyltransferase  32.39 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000034512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
285 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  26.39 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
197 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.82 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  26.81 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04410  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.42 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2030  hypothetical protein  27.52 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
347 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2763  hypothetical protein  26.06 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2706  hypothetical protein  26.06 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  29.34 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.05 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  26.81 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1562  ferrichrome-binding protein  33.33 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2047  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  25.87 
 
 
529 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000333496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  28.57 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00720  acetyltransferase, GNAT family  38.24 
 
 
102 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0478  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  28.28 
 
 
190 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
178 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
175 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  30.41 
 
 
187 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 
171 aa  41.2  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
176 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 
178 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
174 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  26.11 
 
 
182 aa  41.2  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2634  hypothetical protein  29.29 
 
 
203 aa  41.2  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2374  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148578  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
170 aa  40.8  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
178 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  34.15 
 
 
195 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>