56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0412 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0412  hydrogenase expression/synthesis HypA  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65842  normal  0.014846 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0192  hydrogenase expression/synthesis, HypA  85.29 
 
 		 136 aa  253  7e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.342154 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1306  hydrogenase expression/synthesis, HypA  73.33 
 
 		 136 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.551404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1569  hypothetical protein  64.44 
 
 		 134 aa  173  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  45.52 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.533701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  39.58 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.03 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  30.4 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1272  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.03 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00563885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  37.18 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  32.05 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.58 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.71 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  34.52 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2023  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.07 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.44 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  35.71 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.26 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1879  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2415  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774419  hitchhiker  0.0000872958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.91 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.26 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2483  hydrogenase expression/synthesis HypA  36.84 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1911  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.63 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0043415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2113  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.26 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00315228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.63 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.86 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.86 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.63 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.77 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.89 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.62 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.03 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.62 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.64 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  35.9 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  31.65 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.21 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1755  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.32 
 
 		 116 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.27 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.77 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.93 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.28 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.75 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.75 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.75 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.91 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  26.32 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.26 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.28 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 908 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.5 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>