30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2075 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2928    91.65 
 
 
2346 bp  791    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292593  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  89.97 
 
 
1986 bp  710    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  89.73 
 
 
1968 bp  648    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  90.56 
 
 
2112 bp  731    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2075    100 
 
 
627 bp  1243    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  95.53 
 
 
1986 bp  1021    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  88.54 
 
 
1998 bp  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  90.2 
 
 
2382 bp  726    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  91.49 
 
 
2037 bp  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  91.16 
 
 
1974 bp  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  90.43 
 
 
2106 bp  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  90.88 
 
 
2361 bp  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  89.53 
 
 
2103 bp  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  90.48 
 
 
1977 bp  735    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  87.73 
 
 
1974 bp  593  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2661    86.96 
 
 
1656 bp  567  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.308299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  86.03 
 
 
2052 bp  519  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  85.71 
 
 
2004 bp  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  85.28 
 
 
1983 bp  426  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  83.07 
 
 
1974 bp  355  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  83.65 
 
 
1989 bp  311  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  88.52 
 
 
213 bp  196  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  85.37 
 
 
1962 bp  135  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  83.33 
 
 
252 bp  111  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  88.66 
 
 
618 bp  105  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  90 
 
 
1965 bp  95.6  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4183    87.01 
 
 
138 bp  73.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.34276  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  86.21 
 
 
2085 bp  52  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  87.5 
 
 
1740 bp  48.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0266  hypothetical protein  86.54 
 
 
243 bp  48.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>