253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1195 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1195  ybaK/ebsC protein  100 
 
 
162 aa  335  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  75.16 
 
 
163 aa  259  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  67.28 
 
 
163 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  67.28 
 
 
163 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  67.28 
 
 
163 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  67.28 
 
 
163 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  67.28 
 
 
163 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  67.28 
 
 
163 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  67.28 
 
 
163 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  66.05 
 
 
163 aa  226  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  69.93 
 
 
160 aa  225  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  69.28 
 
 
160 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  69.28 
 
 
160 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  65.62 
 
 
167 aa  221  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  67.97 
 
 
160 aa  220  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  67.53 
 
 
160 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  65.19 
 
 
161 aa  218  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  66.05 
 
 
163 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  65.43 
 
 
163 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  65.43 
 
 
163 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  66.23 
 
 
160 aa  216  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  64.94 
 
 
161 aa  216  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  64.81 
 
 
163 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.81 
 
 
163 aa  213  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  62.96 
 
 
163 aa  213  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  64.2 
 
 
163 aa  213  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  61.49 
 
 
162 aa  213  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  64.2 
 
 
163 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  62.96 
 
 
163 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  64.1 
 
 
166 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  64.1 
 
 
166 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  61.11 
 
 
166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  65.58 
 
 
160 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  62.35 
 
 
175 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  60.87 
 
 
163 aa  206  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  61.49 
 
 
164 aa  206  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  62.82 
 
 
163 aa  204  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  61.73 
 
 
163 aa  203  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  61.11 
 
 
163 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.24 
 
 
160 aa  201  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  61.44 
 
 
160 aa  201  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  59.88 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  60.65 
 
 
163 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  58.86 
 
 
163 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  60 
 
 
163 aa  191  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  60 
 
 
161 aa  191  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.52 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  42.18 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  35.37 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  40.58 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  39.57 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  35.44 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  37.25 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  39.57 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  34.93 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  35.86 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  35.17 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  30.92 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  37.41 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  38.3 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  27.61 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  34.93 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  29.88 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  34.21 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  32.19 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  28.83 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  36.99 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  26.38 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  28.22 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  26.38 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  26.38 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  26.38 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  26.38 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  26.38 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  33.58 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  36.69 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  30.82 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  28.66 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  31.65 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  26.45 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  25 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  26.83 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  28.66 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  25.62 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  31.25 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  28.92 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  28.66 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  29.03 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  26.62 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  30.61 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  27.4 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>