More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1176 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 462 aa  935    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0592  glutamyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  42.47 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 496 aa  363  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 469 aa  359  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 469 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 488 aa  352  7e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 467 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 486 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 467 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 470 aa  346  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 467 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 500 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 491 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1080  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 491 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 480 aa  338  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 469 aa  336  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 464 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 492 aa  335  7e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 474 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 471 aa  333  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 476 aa  332  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 466 aa  332  9e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 485 aa  332  9e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 485 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 491 aa  329  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 484 aa  329  7e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 468 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 466 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 466 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.34 
 
 		 546 aa  324  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 488 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 475 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 504 aa  323  5e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 506 aa  323  5e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 468 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 467 aa  319  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 535 aa  319  7e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 474 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 504 aa  318  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>