More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1489 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  100 
 
 		 360 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.91 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.2 
 
 		 346 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.07 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  51.16 
 
 		 348 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.97 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.13 
 
 		 349 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.42 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.57 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  49 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.02 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 		 356 aa  225  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.57 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.09 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.81 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.02 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.99 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.01 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.63 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.96 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.57 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  33.79 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.14 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.72 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.61 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  33.95 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 		 344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.95 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.95 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.23 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.65 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.43 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.95 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.1 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.54 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.08 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.24 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59150  secondary alcohol dehydrogenase (SADH1)  31.36 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318338  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.91 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.14 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.54 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.54 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  33.91 
 
 		 361 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.54 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.54 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.2 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>