More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3916 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3916  RNA polymerase sigma factor SigF  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3949  RNA polymerase sigma factor SigF  62.06 
 
 
262 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1844  RNA polymerase sigma factor SigF  64.03 
 
 
258 aa  327  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4392  RNA polymerase sigma factor SigF  61.66 
 
 
258 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  hitchhiker  0.00000384566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1897  FliA/WhiG subfamily RNA polymerase sigma 28 subunit  61.66 
 
 
265 aa  324  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4329  RNA polymerase sigma factor SigF  61.26 
 
 
258 aa  322  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4930  RNA polymerase sigma factor SigF  59.06 
 
 
258 aa  315  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1510  RNA polymerase sigma factor SigF  49.21 
 
 
259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.252982  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0689  RNA polymerase sigma factor SigF  45.19 
 
 
255 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0670  RNA polymerase sigma factor SigF  45.19 
 
 
255 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1784  RNA polymerase sigma factor SigF  46.03 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0903247  normal  0.197076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2055  RNA polymerase sigma factor SigF  45.49 
 
 
257 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1686  RNA polymerase sigma factor SigF  45.27 
 
 
263 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3085  RNA polymerase sigma factor SigF  43.15 
 
 
261 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4576  FliA/WhiG subfamily RNA polymerase sigma 28 subunit  40.76 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1033  RNA polymerase sigma factor SigB  35.39 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0896  RNA polymerase sigma factor SigB  35.39 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1068  RNA polymerase sigma factor SigB  35.39 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67062e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0928  RNA polymerase sigma factor SigB  35.39 
 
 
258 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0992  RNA polymerase sigma factor SigB  35.39 
 
 
257 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0913  RNA polymerase sigma factor SigB  35.39 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000335438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1159  RNA polymerase sigma factor SigB  34.75 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4270  RNA polymerase sigma factor SigB  34.75 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0899706  hitchhiker  0.00271333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1813  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.47 
 
 
258 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0724574  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0903  RNA polymerase sigma factor SigB  34.98 
 
 
257 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1677  RNA polymerase sigma factor SigB  34.04 
 
 
256 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0455  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.79 
 
 
284 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.333404  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1661  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  32.78 
 
 
253 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.691015  normal  0.251698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1358  RNA polymerase, sigma 28 subunit  32.68 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3488  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  30.58 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2101  RNA polymerase sigma factor SigB  33.19 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0557419  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2138  RNA polymerase sigma factor SigB  33.19 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0437  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.63 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1086  RNA polymerase sigma factor SigB  34.32 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0876  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  33.02 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3813  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3829  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3903  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.715722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4182  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0460854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4094  sporulation sigma factor SigF  35.25 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5514999999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0564  RNA polymerase, sigma 28 subunit  34.2 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.244424  normal  0.87971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3691  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.27 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5363  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.54 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2068  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.49 
 
 
261 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0559  RNA polymerase sigma factor  34.05 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2905  Sig B/F/G subfamily RNA polymerase sigma-28  34.78 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.326727  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2771  sporulation sigma factor SigF  34.02 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000547183  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0022  Sigma-70 region 2  30.3 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1715  sigma-70 region 2 domain-containing protein  32.73 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  32.11 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  32.11 
 
 
259 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3872  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  32.03 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3692  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  33.19 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  31.64 
 
 
252 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  32.51 
 
 
273 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8303  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  34.63 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2112  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.89 
 
 
360 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2642  RNA polymerase, sigma 28 subunit  31.36 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2687  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  31.36 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal  0.0213055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2671  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  31.36 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27140  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  33.78 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.967922  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3805  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  34.31 
 
 
301 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0009  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  31.89 
 
 
255 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000498773  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2900  RNA polymerase, sigma 28 subunit  31.12 
 
 
252 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00742668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  32.16 
 
 
250 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1496  sigma 28 (flagella/sporulation)  32.02 
 
 
270 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1334  RNA polymerase sigma factor  34.63 
 
 
308 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1163  RNA polymerase, sigma 28 subunit  30.17 
 
 
257 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3755  sigma 28 subunit  33.04 
 
 
338 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.49 
 
 
259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01790  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  33.05 
 
 
267 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  30.49 
 
 
259 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7708  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.04 
 
 
353 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0974  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  33.04 
 
 
376 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.279124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  33.04 
 
 
256 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  32.38 
 
 
255 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.49 
 
 
292 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  33.33 
 
 
272 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1925  sigma-70 region 4 domain-containing protein  30.38 
 
 
282 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
259 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0400  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  29.02 
 
 
249 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0319697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  33.93 
 
 
234 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
259 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
259 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
259 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
289 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
289 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
289 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
289 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  31.3 
 
 
257 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1281  RNA polymerase sigma factor SigF  33 
 
 
263 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1298  RNA polymerase sigma factor SigF  33 
 
 
263 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0930015  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1310  RNA polymerase sigma factor SigF  33 
 
 
263 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5429  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  29.46 
 
 
276 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  33.33 
 
 
269 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>