103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2602 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2602  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 
210 aa  438  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.182735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2601  2OG-Fe(II) oxygenase  51.9 
 
 
210 aa  246  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.188092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3501  2OG-Fe(II) oxygenase  27.93 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1705  oxidoreductase domain-containing protein  42.86 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12301  hypothetical protein  35.94 
 
 
186 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6279  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.86 
 
 
165 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20491  putative hydroxylase  36.84 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0037  2OG-Fe(II) oxygenase  36.84 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12561  putative hydroxylase  35.53 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2258  putative hydroxylase  37.1 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0352243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0721  putative hydroxylase  41.94 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000319663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0750  putative hydroxylase  41.94 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.904412  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2196  putative hydroxylase  37.1 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0741  putative hydroxylase  40.32 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0366446  hitchhiker  0.0000066194 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1577  putative hydroxylase  35.53 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.572766  normal  0.0227046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3634  putative hydroxylase  40.32 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3244  putative hydroxylase  35.44 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054374  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0717  putative hydroxylase  35.44 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266806  hitchhiker  0.000189122 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0775  putative hydroxylase  38.67 
 
 
221 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1262  putative hydroxylase  36 
 
 
221 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0698  putative hydroxylase  35.44 
 
 
224 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00417487  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2001  putative hydroxylase  32.35 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.563142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3913  putative hydroxylase  34.52 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2812  putative hydroxylase  34.15 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.192542  decreased coverage  0.000000224129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1675  putative hydroxylase  32 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.899153  normal  0.0319364 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16191  putative hydroxylase  37.33 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13321  putative hydroxylase  34.67 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2273  putative hydroxylase  31.71 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0612  2OG-Fe(II) oxygenase  30.85 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13531  putative hydroxylase  34.67 
 
 
221 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13621  putative hydroxylase  33.33 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.436442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1929  putative hydroxylase  35.06 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1523  2OG-Fe(II) oxygenase  31.71 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0015  putative hydroxylase  32.91 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal  0.457656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03560  putative hydroxylase  27.85 
 
 
226 aa  48.5  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3048  putative hydroxylase  35.48 
 
 
227 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0862  putative hydroxylase  31.76 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0892  putative hydroxylase  31.76 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.137748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0249  2OG-Fe(II) oxygenase  23.03 
 
 
325 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1201  putative hydroxylase  32.58 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3078  putative hydroxylase  32.93 
 
 
228 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4677  putative hydroxylase  33.87 
 
 
227 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000773199  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4046  putative hydroxylase  31.33 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0905  putative hydroxylase  30.59 
 
 
226 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4316  putative hydroxylase  30.59 
 
 
226 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0120702 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2199  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 
224 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.568044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3541  putative hydroxylase  31.4 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1130  putative hydroxylase  35.11 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3803  putative hydroxylase  35.48 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327184 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3916  putative hydroxylase  35.48 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.721944  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3426  putative hydroxylase  33.87 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475229  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0838  putative hydroxylase  35.38 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143447 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0512  putative hydroxylase  33.87 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal  0.011367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1077  putative hydroxylase  34.43 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0528  putative hydroxylase  33.87 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0701  putative hydroxylase  37.5 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0577  2OG-Fe(II) oxygenase  35.48 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0176076  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4714  putative hydroxylase  32.14 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.730869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0099  2OG-Fe(II) oxygenase  32.43 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0892  putative hydroxylase  32.14 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132513  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3793  putative hydroxylase  32.14 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2877  putative hydroxylase  33.33 
 
 
228 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4660  putative hydroxylase  31.33 
 
 
227 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2089  putative hydroxylase  32.93 
 
 
229 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1709  putative hydroxylase  34.72 
 
 
230 aa  45.1  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.822877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0200  putative hydroxylase  32.58 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0103343  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7101  putative hydroxylase  35.38 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0792  putative hydroxylase  31.46 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182432  normal  0.929966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3557  putative hydroxylase  32.14 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4192  putative hydroxylase  32.14 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540469  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4479  putative hydroxylase  35.48 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4810  putative hydroxylase  32.14 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63397  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1690  putative hydroxylase  32.58 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1609  putative hydroxylase  32.58 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0377  putative hydroxylase  35.48 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925919  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0872  putative hydroxylase  35.48 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3575  putative hydroxylase  35.48 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.574336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5473  putative hydroxylase  32.14 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5004  putative hydroxylase  35.48 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1638  putative hydroxylase  34.72 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1949  2OG-Fe(II) oxygenase  34.43 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00771  putative hydroxylase  35.48 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2838  2OG-Fe(II) oxygenase  35.48 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2559  putative hydroxylase  29.63 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0859  putative hydroxylase  35.48 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0045  putative hydroxylase  29.63 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2839  putative hydroxylase  35.48 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.113073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0828  putative hydroxylase  35.48 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2548  putative hydroxylase  35.48 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7102  putative hydroxylase  33.87 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0990  2OG-Fe(II) oxygenase  37.1 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.20118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0953  putative hydroxylase  35.48 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12420  putative hydroxylase  27.91 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.455137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00788  hypothetical protein  35.48 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0219  putative hydroxylase  33.87 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3334  putative hydroxylase  31.71 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.437526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0803  putative hydroxylase  38.27 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3968  putative hydroxylase  29.27 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  30.86 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1910  putative hydroxylase  32.5 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178432  normal  0.718832 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>