178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2189 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 96 aa  185  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  59.04 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  55.42 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  65.82 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  60.24 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  46.34 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  45.45 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  48.91 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  52.78 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  50.6 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  53.33 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  49.38 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  47.62 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  47.62 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  47.22 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  43.84 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  45.68 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  43.75 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  44.59 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  46.84 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  45.57 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  45.57 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  45.57 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  45.57 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  45.57 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  44.3 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  45.57 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  45.33 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  40.96 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  44.3 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  40.54 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  33.71 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  44.3 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  37.8 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  39.71 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  33.77 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 		 196 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  36.07 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  34.25 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  39.13 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  41.76 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  33.33 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  36.11 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  44.83 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  31.94 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  31.94 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  44.44 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3520  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  30.49 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  40.54 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  34.78 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  45.28 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  39.66 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  43.1 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  35.37 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  39.66 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  34.78 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  39.66 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  39.66 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  30.16 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2260  hypothetical protein  34.43 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.48974  normal  0.571273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  39.66 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  33.87 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.82447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>