178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2196 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 
326 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  74.13 
 
 
330 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  75 
 
 
317 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  74.61 
 
 
311 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3012  protein of unknown function UPF0052 and CofD  74.13 
 
 
324 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  66.56 
 
 
337 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.41 
 
 
358 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  58.62 
 
 
321 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  59.09 
 
 
330 aa  355  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.59 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  60.13 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5611  protein of unknown function UPF0052 and CofD  61.45 
 
 
428 aa  332  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.796234  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  58.49 
 
 
326 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1945  protein of unknown function UPF0052 and CofD  60.13 
 
 
325 aa  320  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69785  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.21 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  54.83 
 
 
339 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  56.83 
 
 
323 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.33 
 
 
328 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.86 
 
 
350 aa  301  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2061  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.97 
 
 
368 aa  301  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282535  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  53.14 
 
 
340 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.14 
 
 
340 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.14 
 
 
340 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1635  hypothetical protein  56.65 
 
 
360 aa  295  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.919127  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  53.33 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.83 
 
 
339 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  49.84 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11320  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  52.87 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.763396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.14 
 
 
344 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.89 
 
 
333 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2044  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.52 
 
 
366 aa  278  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3100  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.48 
 
 
331 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582963  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.16 
 
 
320 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50 
 
 
337 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  47.01 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  47.48 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  37.65 
 
 
458 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  36.36 
 
 
316 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.25 
 
 
463 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  35.35 
 
 
457 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  35.69 
 
 
469 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.2 
 
 
453 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.55 
 
 
458 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.55 
 
 
458 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  38.93 
 
 
451 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  35.4 
 
 
496 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  33.82 
 
 
421 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  33.63 
 
 
461 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  34.81 
 
 
502 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  33.92 
 
 
465 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  32.74 
 
 
461 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.04 
 
 
428 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  33.92 
 
 
465 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.86 
 
 
438 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  32.45 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.09 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  36.56 
 
 
456 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  31.76 
 
 
461 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.74 
 
 
457 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.01 
 
 
437 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  34.73 
 
 
469 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  31.23 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.53 
 
 
442 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.97 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  31.95 
 
 
439 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.88 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.01 
 
 
339 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.62 
 
 
314 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.02 
 
 
314 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.18 
 
 
439 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.75 
 
 
317 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  35.77 
 
 
327 aa  159  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  31.53 
 
 
341 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  33.81 
 
 
322 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.45 
 
 
434 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  35.07 
 
 
321 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.25 
 
 
325 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.93 
 
 
317 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  31.34 
 
 
317 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  31.34 
 
 
317 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  31.34 
 
 
317 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.05 
 
 
388 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.34 
 
 
358 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  31.94 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  31.94 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  31.94 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  31.94 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  33.95 
 
 
324 aa  152  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  31.94 
 
 
317 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  35.41 
 
 
317 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.44 
 
 
317 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.14 
 
 
443 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.61 
 
 
336 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  34.56 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.43 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  33.23 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.66 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.83 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.94 
 
 
336 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>