41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1495 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
441 aa  887    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  58.39 
 
 
464 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  54.09 
 
 
440 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  51.58 
 
 
441 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  51.48 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  49.43 
 
 
424 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  48.43 
 
 
442 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  35.9 
 
 
435 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  36.84 
 
 
430 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  36.21 
 
 
444 aa  226  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  33.97 
 
 
435 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  35.32 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  33.1 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  34.03 
 
 
450 aa  196  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  33.57 
 
 
450 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  22.49 
 
 
443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  23.78 
 
 
449 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  23.32 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  24.05 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  23.57 
 
 
443 aa  93.6  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  24.03 
 
 
441 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  24.81 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  24.08 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  25.56 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  24.36 
 
 
443 aa  90.1  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  23.35 
 
 
448 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  24.75 
 
 
442 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  21.17 
 
 
442 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  24.23 
 
 
445 aa  86.7  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  23.33 
 
 
431 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  24.93 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  27.59 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  22.35 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  25.94 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  21.38 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  22.05 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  28.21 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  23.26 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  26.02 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  20.1 
 
 
437 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  23.3 
 
 
407 aa  57  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>