26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0330 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  100 
 
 		 676 aa  1415    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  42.86 
 
 		 655 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 624 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  36.93 
 
 		 689 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  35.1 
 
 		 561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  30.46 
 
 		 543 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  31.85 
 
 		 539 aa  277  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  28.07 
 
 		 681 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  27.17 
 
 		 693 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  27.17 
 
 		 693 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  27.17 
 
 		 693 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  29.34 
 
 		 552 aa  206  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  24.93 
 
 		 745 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  24.22 
 
 		 671 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  24.71 
 
 		 715 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  23.51 
 
 		 667 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0086  hypothetical protein  21.77 
 
 		 779 aa  87  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  26.61 
 
 		 751 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  23.71 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  23.08 
 
 		 774 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  23.83 
 
 		 774 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  23.16 
 
 		 767 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  23.16 
 
 		 767 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  21.69 
 
 		 797 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  21.69 
 
 		 797 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  21.69 
 
 		 797 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>