More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0108 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0108  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
182 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0544  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
172 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 
174 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1189  adenine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
171 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1252  adenine phosphoribosyltransferase  49.65 
 
 
190 aa  137  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000946756  hitchhiker  0.00866673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
180 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
170 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
172 aa  134  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
170 aa  134  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0881  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
172 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
171 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
174 aa  132  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
170 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  41.48 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
181 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1201  adenine phosphoribosyltransferase  46.53 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  0.998677 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0968  Adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 
184 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
174 aa  125  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
187 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
187 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
175 aa  125  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
175 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
172 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  39.43 
 
 
177 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
198 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
181 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
172 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
172 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
187 aa  124  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
172 aa  124  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
180 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
170 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
172 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
171 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
181 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  37.64 
 
 
181 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  37.64 
 
 
181 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  37.08 
 
 
181 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
181 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0821  adenine phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
175 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
182 aa  122  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
179 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
180 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
193 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  45.89 
 
 
173 aa  122  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
175 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
181 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 
424 aa  121  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  41.29 
 
 
182 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 
177 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
181 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
176 aa  121  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
181 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  41.56 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf610  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
183 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
183 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
176 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  40.46 
 
 
183 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
171 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
183 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
183 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
183 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
183 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
183 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  39.64 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>