More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2428 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 370 aa  738    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  50.54 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  39.26 
 
 		 514 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  38.16 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  38.46 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  39.14 
 
 		 391 aa  209  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  39.16 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  36.6 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  38.97 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  38.28 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  33.87 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  34.27 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  38.75 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  34.85 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  36.91 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  36.43 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  36.55 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  35.16 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  36.59 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  36.53 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  38.94 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  35.49 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  35.01 
 
 		 384 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  36.34 
 
 		 386 aa  176  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  37.74 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  28.65 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  35.51 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  32.63 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  35.23 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  32.89 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  34.06 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 		 521 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  34.4 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  34.4 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  29.03 
 
 		 390 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  33.61 
 
 		 390 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  32.46 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6328  aminotransferase class I and II  36.07 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  31.54 
 
 		 393 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  35.23 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  35.6 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  31.99 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  32.38 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  30.26 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 		 405 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  36.48 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  34.19 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  28.5 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  28.24 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  34.87 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  38.46 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  28.24 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  33.15 
 
 		 390 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  28.5 
 
 		 383 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  28.24 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  32.36 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  28.24 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  31.06 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  31.7 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  33.15 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  33.15 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  33.15 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  36.13 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  34.74 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  27.98 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  27.98 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  27.97 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  31.3 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  27.79 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  28.5 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  32.88 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  32.88 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  31.06 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  32.88 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  32.6 
 
 		 390 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  30.35 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  30.25 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  32.43 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  27.88 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  27.92 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  29.72 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  27.76 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  31.59 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  27.39 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  27.68 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  30.67 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>