More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2506 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  67.29 
 
 		 480 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  66.04 
 
 		 480 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  100 
 
 		 494 aa  975    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  66.04 
 
 		 480 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  69.26 
 
 		 479 aa  670    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  66.88 
 
 		 480 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  67.08 
 
 		 480 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  67.29 
 
 		 480 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  67.08 
 
 		 480 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  65.62 
 
 		 480 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  64.73 
 
 		 482 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  65.7 
 
 		 480 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  64.73 
 
 		 482 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  66.67 
 
 		 480 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  63.75 
 
 		 478 aa  559  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  57.71 
 
 		 481 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  57.71 
 
 		 481 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  54.63 
 
 		 491 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  54.63 
 
 		 491 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  54.63 
 
 		 491 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  52.77 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  50 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  51.64 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  50 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  48.23 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  49.05 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  45.25 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  44.39 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  44.34 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  48.24 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  44.34 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  44.03 
 
 		 452 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  44.11 
 
 		 454 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  44.34 
 
 		 454 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  44.11 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  42.5 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  42.5 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  42.5 
 
 		 454 aa  359  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  43.2 
 
 		 453 aa  359  7e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  42.98 
 
 		 453 aa  359  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  43.02 
 
 		 454 aa  358  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  42.27 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  44.34 
 
 		 451 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  43.42 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  44.16 
 
 		 455 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  43.65 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  42.73 
 
 		 454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  42.95 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  43.64 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  41.69 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  42.03 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  44.31 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  42.31 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  43.06 
 
 		 454 aa  335  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  42.11 
 
 		 451 aa  332  9e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  44.34 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  40.95 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  42.24 
 
 		 455 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 		 446 aa  306  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  40.52 
 
 		 475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  37.67 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  38.85 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  41.25 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  40.24 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  39.06 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  40.91 
 
 		 476 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  39.86 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  36.11 
 
 		 445 aa  287  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  37.61 
 
 		 470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  40.95 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  39.51 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  37.72 
 
 		 459 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  37.9 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  39.44 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  34.55 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  37.14 
 
 		 479 aa  275  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  39.95 
 
 		 470 aa  276  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  38.29 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  38.52 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  37.92 
 
 		 471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  37.61 
 
 		 473 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  35.62 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  38.37 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  35.71 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  37.07 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  35.45 
 
 		 445 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  35.71 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  35.48 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  38.31 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  36.93 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  38.39 
 
 		 459 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  35.48 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  35.21 
 
 		 445 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.92 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  35.24 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  39.34 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  34.06 
 
 		 465 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  37.65 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  35.01 
 
 		 448 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.1 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>