281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0859 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  100 
 
 
89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  55.81 
 
 
97 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  54.65 
 
 
97 aa  93.6  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  50.55 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  54.88 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  56.63 
 
 
95 aa  87.4  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  49.41 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  47.13 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  49.41 
 
 
94 aa  83.6  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  55.42 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  51.72 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  51.76 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  55.42 
 
 
92 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  54.12 
 
 
93 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  56 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  48.19 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  45.98 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  49.41 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  52.94 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  47.62 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  48.81 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  60.94 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  51.39 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  59.09 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  48.86 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  50.59 
 
 
93 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  51.14 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  57.33 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  48.81 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  44.58 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  46.99 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  46.07 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  44.19 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  43.18 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  45.98 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  43.75 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  43.75 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  46.43 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  43.18 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  42.86 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  45.78 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  47.06 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  42.05 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  44.05 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  48.35 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  41.67 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  43.75 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  40.48 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  51.35 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  43.82 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  53.52 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  41.86 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  44.71 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  45.35 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  48 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  40.91 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  50 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  48.78 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  49.23 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  43.02 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  52.17 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  48.28 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  50 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  44.05 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  43.02 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  37.5 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  56.52 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  47.67 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  53.16 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  44.05 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  52.24 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  45.83 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  42.5 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  42.5 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  44.16 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  46.99 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  45.33 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  40 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  47.06 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  48.19 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  39.74 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  41.25 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  44.44 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  41.25 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  52.24 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  41.25 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  41.25 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  40.54 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  52.17 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  48.19 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  47.3 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  40.74 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  40.79 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  48.53 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  45.59 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  47.22 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  44 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>