299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0039 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  95 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0003    92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0003  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0012  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.145187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0007  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0003  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0003  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.426461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0081  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.491812  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0099  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t73  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t74  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0098  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0692613  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0097  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0752348  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0068  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0072  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0100  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205949 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0006  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0003  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.14318  hitchhiker  0.000405393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0002  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217421  hitchhiker  0.000407536 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>