More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0376 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  97.44 
 
 
351 aa  696    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
351 aa  709    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  57.06 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  54.34 
 
 
353 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.74 
 
 
367 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  52.86 
 
 
355 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  52.86 
 
 
354 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.43 
 
 
354 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.42 
 
 
354 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.86 
 
 
354 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  48 
 
 
353 aa  349  5e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.71 
 
 
354 aa  348  8e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.01 
 
 
353 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.73 
 
 
353 aa  346  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.95 
 
 
341 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.28 
 
 
357 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.26 
 
 
355 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.86 
 
 
363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.89 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.42 
 
 
357 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.54 
 
 
374 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.86 
 
 
372 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.18 
 
 
354 aa  328  8e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.45 
 
 
547 aa  328  9e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.02 
 
 
356 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  44.89 
 
 
354 aa  325  6e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.83 
 
 
354 aa  325  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  45.35 
 
 
358 aa  325  9e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.87 
 
 
375 aa  322  8e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  44.54 
 
 
380 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  43.87 
 
 
363 aa  317  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.71 
 
 
387 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.09 
 
 
355 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  42.24 
 
 
375 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.57 
 
 
379 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.35 
 
 
362 aa  298  7e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.35 
 
 
385 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.35 
 
 
385 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.14 
 
 
383 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.37 
 
 
395 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.99 
 
 
348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.61 
 
 
376 aa  282  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.76 
 
 
360 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  41.64 
 
 
354 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.86 
 
 
381 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.46 
 
 
352 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.52 
 
 
352 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.06 
 
 
382 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.12 
 
 
390 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.88 
 
 
352 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  36.68 
 
 
354 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.82 
 
 
354 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.26 
 
 
353 aa  265  7e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.24 
 
 
357 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.53 
 
 
368 aa  259  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.91 
 
 
327 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.1 
 
 
354 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.07 
 
 
381 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.07 
 
 
381 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.91 
 
 
372 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  37.5 
 
 
367 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.14 
 
 
374 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.3 
 
 
360 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.38 
 
 
332 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.14 
 
 
356 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.55 
 
 
351 aa  229  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.48 
 
 
327 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.04 
 
 
339 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.06 
 
 
325 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.01 
 
 
339 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.9 
 
 
355 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.53 
 
 
387 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.58 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.22 
 
 
325 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.62 
 
 
321 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.1 
 
 
316 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.84 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.82 
 
 
357 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.69 
 
 
322 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.81 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.17 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.96 
 
 
316 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  35.16 
 
 
321 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.31 
 
 
325 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  30.87 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  30.87 
 
 
320 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
436 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.87 
 
 
316 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.87 
 
 
316 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  30.87 
 
 
316 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.11 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.93 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.79 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.79 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.79 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.87 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.79 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.7 
 
 
326 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.2 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.2 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>