More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0230 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0232  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
249 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0230  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
249 aa  489  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0923651  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0929  flagellar biosynthesis protein FliP  69.88 
 
 
251 aa  340  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0694  flagellar biosynthesis protein FliP  65.6 
 
 
251 aa  317  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1394  flagellar biosynthesis protein FliP  56.38 
 
 
249 aa  265  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  48.25 
 
 
247 aa  234  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  47.2 
 
 
257 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  48.07 
 
 
252 aa  225  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  42.11 
 
 
251 aa  224  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  45.92 
 
 
260 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  44.98 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  44.69 
 
 
250 aa  221  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  46.96 
 
 
244 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  46.72 
 
 
244 aa  217  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  46.52 
 
 
244 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  46.52 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  43.97 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  46.22 
 
 
252 aa  215  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  43.53 
 
 
247 aa  215  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  45.98 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  45.61 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  44.08 
 
 
248 aa  211  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  46.61 
 
 
260 aa  211  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  44.35 
 
 
244 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  41.08 
 
 
266 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  45.8 
 
 
256 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  44.59 
 
 
261 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0186  flagellar biosynthetic protein FliP  43.64 
 
 
262 aa  209  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.14334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 
221 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  47.17 
 
 
222 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 
245 aa  209  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 
257 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  46.76 
 
 
289 aa  208  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  46.01 
 
 
222 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  44.89 
 
 
289 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  51.29 
 
 
254 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  43.35 
 
 
248 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  44.03 
 
 
238 aa  205  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  43.35 
 
 
248 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  43.56 
 
 
252 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  41.39 
 
 
248 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  41.39 
 
 
248 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  41.39 
 
 
248 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  41.39 
 
 
248 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  41.11 
 
 
248 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  45.37 
 
 
299 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  41.87 
 
 
248 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  46.05 
 
 
289 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 
247 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  42.62 
 
 
255 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 
248 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 
248 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  50.52 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  44.7 
 
 
247 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  42.04 
 
 
251 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  42.04 
 
 
255 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  41.59 
 
 
251 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  40.56 
 
 
245 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  49.11 
 
 
223 aa  198  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  43.98 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  42.67 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  41.81 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  43.89 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  42.24 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  44.02 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  42.61 
 
 
250 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  43.52 
 
 
255 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0655  flagellar biosynthesis protein FliP  43.85 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  41.59 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
262 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  42.91 
 
 
243 aa  195  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  42.53 
 
 
255 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  42.17 
 
 
250 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
293 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  45.89 
 
 
317 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  45.54 
 
 
281 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
250 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  45.6 
 
 
259 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  41.2 
 
 
245 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  41.2 
 
 
245 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  41.2 
 
 
245 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  41.2 
 
 
245 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  41.2 
 
 
245 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 
246 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  43.54 
 
 
254 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  42.79 
 
 
264 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  41.2 
 
 
245 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  41.2 
 
 
245 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  38.84 
 
 
253 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  39.41 
 
 
261 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  43.96 
 
 
262 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  40.89 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  40.89 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  40.89 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  40.89 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  44.44 
 
 
249 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  38.27 
 
 
253 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  38.27 
 
 
253 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  38.27 
 
 
253 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>