More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1826 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1826  Alpha/beta hydrolase fold-3  100 
 
 
315 aa  645    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0590291  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2246  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.18 
 
 
312 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0592  putative lipase/esterase  47.52 
 
 
322 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5077  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.12 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0300585  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.31 
 
 
312 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4504  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.16 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0564939  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3282  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.48 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  41.98 
 
 
305 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6421  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.96 
 
 
303 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19712  normal  0.373697 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5236  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.39 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0824  putative lipase (esterase)  40.6 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.529506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3319  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.06 
 
 
318 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.571151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5048  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.06 
 
 
318 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0615  lipolytic protein  37.37 
 
 
318 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4976  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.63 
 
 
318 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3965  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.61 
 
 
309 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.74 
 
 
319 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.42 
 
 
319 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1955  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.42 
 
 
319 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0494  putative lipase  37.42 
 
 
319 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0983  putative lipase  37.42 
 
 
319 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2132  lipase (esterase)  37.42 
 
 
319 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1845  lipase, putative  37.66 
 
 
318 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0764  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.42 
 
 
319 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3592  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4456  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.63 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477354  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  38.64 
 
 
316 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4506  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.78 
 
 
321 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6169  putative lipolytic enzyme  35.99 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71110  putative lipolytic enzyme  36.33 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.65 
 
 
309 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.71 
 
 
318 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  36.68 
 
 
320 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.04 
 
 
375 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.75 
 
 
310 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.55 
 
 
371 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  35.34 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.13 
 
 
310 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.13 
 
 
310 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.43 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.73 
 
 
301 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.51 
 
 
311 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  33.45 
 
 
314 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05191  esterase/lipase protein  33.44 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00691331  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.9 
 
 
314 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.08 
 
 
313 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.98 
 
 
324 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.13 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.34 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.02 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  35.63 
 
 
319 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.7 
 
 
325 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282555  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.08 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.77 
 
 
325 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.19 
 
 
376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.72 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  37.29 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.77 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.82 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.89 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.82 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.66 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.56 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  29.93 
 
 
321 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.32 
 
 
317 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.41 
 
 
317 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.65 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.28 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  33.86 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.2 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.21 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.2 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.2 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  29.59 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.67 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.97 
 
 
306 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  34.15 
 
 
305 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.78 
 
 
311 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  34.1 
 
 
309 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.06 
 
 
326 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.21 
 
 
314 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.84 
 
 
344 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  31 
 
 
315 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.47 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.56 
 
 
308 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  32.8 
 
 
376 aa  125  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.43 
 
 
352 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.01 
 
 
313 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.6 
 
 
321 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.34 
 
 
323 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.98 
 
 
370 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  32.71 
 
 
320 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.34 
 
 
315 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  33.62 
 
 
344 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.64 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.58 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.65 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.11 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4350  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.32 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00963148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>