237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0133 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  100 
 
 
516 aa  1058    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 
513 aa  681    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  73.67 
 
 
516 aa  762    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  55.12 
 
 
507 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  55.12 
 
 
507 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 
516 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
516 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
516 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  48.63 
 
 
514 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
516 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  47.84 
 
 
512 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  50.89 
 
 
514 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 
512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 
512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  48.71 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
513 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
516 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 
512 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  47.06 
 
 
512 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
510 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  47.59 
 
 
521 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 
521 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  45.49 
 
 
525 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  47.66 
 
 
518 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  47.56 
 
 
512 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  47.08 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 
509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  45.21 
 
 
517 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  45.51 
 
 
533 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  45.99 
 
 
511 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  45.64 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  46.25 
 
 
496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  47.24 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
513 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 
514 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
512 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  47.04 
 
 
509 aa  445  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  47.35 
 
 
510 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.34 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 
511 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  46.67 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  47.29 
 
 
519 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 
511 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  43.73 
 
 
514 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  45.65 
 
 
508 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  43.73 
 
 
514 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  43.73 
 
 
514 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  43.73 
 
 
514 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
511 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  45.44 
 
 
518 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  44.02 
 
 
487 aa  437  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  46.8 
 
 
523 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  45.69 
 
 
511 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
529 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  46.44 
 
 
513 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  48.14 
 
 
510 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  43.73 
 
 
514 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  46.18 
 
 
515 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0622  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  48.21 
 
 
507 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  44.53 
 
 
532 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  48.05 
 
 
515 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  46.55 
 
 
511 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  45.38 
 
 
511 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  43.92 
 
 
514 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
509 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  43.92 
 
 
514 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  43.92 
 
 
514 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
509 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  43.92 
 
 
514 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  43.92 
 
 
514 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  43.92 
 
 
514 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  43.92 
 
 
514 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  43.61 
 
 
509 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  43.92 
 
 
514 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  44.96 
 
 
552 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1593  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
487 aa  430  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  44.64 
 
 
511 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  43.61 
 
 
509 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  44.75 
 
 
532 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  43.92 
 
 
514 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  44.42 
 
 
542 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  44.75 
 
 
532 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  47.23 
 
 
524 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 
511 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  47.93 
 
 
524 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
509 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
509 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
509 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
509 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  43.84 
 
 
542 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  43.92 
 
 
517 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
509 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  46.05 
 
 
511 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  46.27 
 
 
515 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  44.44 
 
 
513 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  42.36 
 
 
540 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>