More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2422 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2422  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 129 aa  234  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.401365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  59.23 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  56.15 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1863  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0765913  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0326  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00616551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  60 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0748  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0407206  normal  0.893825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  53.79 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  51.15 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 124 aa  90.5  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  56.35 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  51.54 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  51.54 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04531  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  59.09 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2968  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>