More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2299 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
525 aa  1066    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  29.35 
 
 
521 aa  177  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  27.6 
 
 
526 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.15 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  29.76 
 
 
521 aa  167  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  26.21 
 
 
537 aa  162  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  28.54 
 
 
519 aa  159  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 
542 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  29.2 
 
 
525 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
554 aa  156  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  27.9 
 
 
553 aa  156  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.9 
 
 
506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  30.05 
 
 
507 aa  153  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  31.41 
 
 
507 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  27.67 
 
 
544 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  26.47 
 
 
510 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  28.09 
 
 
545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  26.76 
 
 
560 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  26.88 
 
 
502 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  26.3 
 
 
516 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  26.77 
 
 
522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 
513 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  28.54 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 
537 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  29.62 
 
 
495 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  25.91 
 
 
491 aa  133  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  27.99 
 
 
526 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  27.55 
 
 
475 aa  130  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  28.53 
 
 
518 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
530 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  24.95 
 
 
487 aa  127  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  25.75 
 
 
529 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
487 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  29.77 
 
 
505 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  29.19 
 
 
541 aa  125  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
506 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  24.09 
 
 
528 aa  123  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.47 
 
 
495 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  26.48 
 
 
760 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  26.38 
 
 
488 aa  120  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  26.01 
 
 
523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  25.97 
 
 
532 aa  118  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  27.8 
 
 
495 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  26.11 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  25.2 
 
 
535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  25.67 
 
 
543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  30.21 
 
 
520 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  25.77 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  26.49 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  25.69 
 
 
537 aa  114  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  27.52 
 
 
505 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  25.18 
 
 
534 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  25.6 
 
 
507 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  27.23 
 
 
505 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  25.58 
 
 
541 aa  113  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.64 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  25.05 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  26.7 
 
 
505 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  25.42 
 
 
472 aa  111  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  26.32 
 
 
534 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.27 
 
 
510 aa  111  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  24.45 
 
 
530 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  26.08 
 
 
501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  28.11 
 
 
510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  25.62 
 
 
515 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  26 
 
 
524 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  26.42 
 
 
505 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  24.83 
 
 
531 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  26.94 
 
 
550 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  26.81 
 
 
550 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  25.38 
 
 
524 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  23.8 
 
 
536 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
534 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
508 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1141  apolipoprotein N-acyltransferase  25.77 
 
 
464 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0258943  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  26.23 
 
 
557 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  24.69 
 
 
519 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  24.79 
 
 
566 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  29.62 
 
 
505 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  24.79 
 
 
522 aa  106  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  27.02 
 
 
511 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1921  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 
629 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0008443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  24.2 
 
 
525 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  25.99 
 
 
532 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  25.51 
 
 
519 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  28.04 
 
 
488 aa  104  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0666  apolipoprotein N-acyltransferase  26.18 
 
 
491 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  22.87 
 
 
536 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  25.06 
 
 
518 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  29.62 
 
 
497 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  26.08 
 
 
516 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
567 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  25.82 
 
 
516 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  24.85 
 
 
567 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  23.37 
 
 
545 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  26.6 
 
 
518 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  23.64 
 
 
507 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  23.02 
 
 
536 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  24.38 
 
 
567 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>