More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1267 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1267  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 437 aa  884    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00682849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.47 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.65 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  46.01 
 
 		 809 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.34 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.03 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  47.2 
 
 		 802 aa  365  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.05 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.06 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.06 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.98 
 
 		 427 aa  358  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.02 
 
 		 425 aa  358  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1189  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.39 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000704507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.14 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.82 
 
 		 419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.25 
 
 		 425 aa  355  5.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  45.35 
 
 		 795 aa  354  1e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 		 426 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.75 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 		 422 aa  354  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.29 
 
 		 419 aa  353  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 419 aa  352  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.73 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.39 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.06 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.09 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.83 
 
 		 428 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.63 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.4 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.21 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.49 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.55 
 
 		 422 aa  346  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.25 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.63 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.25 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  42.36 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.03 
 
 		 425 aa  345  7e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.35 
 
 		 704 aa  345  8e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 421 aa  345  8e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 427 aa  345  8e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.32 
 
 		 417 aa  345  8e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.86 
 
 		 432 aa  345  8.999999999999999e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 		 418 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.4 
 
 		 591 aa  344  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.13 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3413  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.08 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.872928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 		 430 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.22 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.46 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.53 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.76 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.53 
 
 		 426 aa  342  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 		 422 aa  342  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.13 
 
 		 431 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2459  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.01 
 
 		 425 aa  342  9e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.49 
 
 		 423 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 		 428 aa  342  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.57 
 
 		 427 aa  342  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.07 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.8 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.89 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.52 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  43.91 
 
 		 1237 aa  340  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.86 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.45 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  42.13 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.9 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.01 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.73 
 
 		 429 aa  339  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.76 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.8 
 
 		 428 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.45 
 
 		 429 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.86 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>