More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0278 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
453 aa  927    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.35 
 
 
310 aa  120  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.36 
 
 
298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.12 
 
 
301 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.15 
 
 
302 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.15 
 
 
302 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.51 
 
 
304 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.43 
 
 
307 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.55 
 
 
301 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.5 
 
 
289 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.6 
 
 
331 aa  97.8  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.94 
 
 
331 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  27.89 
 
 
306 aa  96.7  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.67 
 
 
302 aa  96.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.66 
 
 
316 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.92 
 
 
307 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.49 
 
 
299 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.41 
 
 
294 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.76 
 
 
286 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.92 
 
 
319 aa  86.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.14 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.82 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.82 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.97 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.25 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  26.35 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.08 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.17 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1097  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.12 
 
 
303 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0136  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.52 
 
 
297 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0038  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
297 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0032  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
297 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.25 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.62 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.45 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.07 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.44 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.31 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  21.57 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.03 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2076  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  0.965956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.9 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0793  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.01 
 
 
302 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.867069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01050  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.305601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2592  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1177  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1433  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2546  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  0.356214 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.25 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1176  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01058  hypothetical protein  25.87 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.315282  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.18 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.45 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  22.41 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.73 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.67 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1962  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.28 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310079  decreased coverage  0.00642577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.91 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  28 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.83 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.22 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.45 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0949  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.58 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.92 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0199  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.24 
 
 
297 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.08 
 
 
289 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.32 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.3 
 
 
290 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.41 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2726  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.6 
 
 
301 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  0.0936253 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00650  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.68 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.62 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0154  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.68 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  30.26 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.29 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0658  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.68 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0642773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.56 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  22.53 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.39 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  30.37 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0190  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0077  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.68 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.39 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1568  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.82 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.912268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.4 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  23.1 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2993  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.36 
 
 
294 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  27.51 
 
 
278 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  29.84 
 
 
281 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4372  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.5 
 
 
294 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.18 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.54 
 
 
324 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.81 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.32 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.74 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3130  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.58 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>