131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11129 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  73.53 
 
 		 70 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  75.81 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  73.77 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.18 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.18 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.18 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.24 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  66.67 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.28 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.05 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.07 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.1 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.96 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.85 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.32 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  57.14 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.56 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.9 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.89 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.94 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.21 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.14 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.95 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.05 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.36 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  53.33 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.22 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  61.22 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.3 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  52.46 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  59.18 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  47.27 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.47 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  54.72 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.61 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.86 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  52.83 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  40 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.34 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.57 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.46 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.98 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.71 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.8 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.18 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.59 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.32 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.29 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.71 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.71 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.48 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.12 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  42.59 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.12 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.12 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.36 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.71 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.06 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.92 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.29 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1894  exonuclease VII, small subunit  35.71 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  47.17 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.51 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 		 68 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.99 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.78 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.78 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1644  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413524 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>