More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10812 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  100 
 
 
303 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  100 
 
 
509 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.94 
 
 
352 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.94 
 
 
354 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.58 
 
 
350 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.08 
 
 
327 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  34.25 
 
 
356 aa  93.6  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.5 
 
 
147 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.01 
 
 
422 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.45 
 
 
354 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  31.91 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  32.87 
 
 
402 aa  87  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  32.61 
 
 
378 aa  87  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.66 
 
 
348 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.66 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.66 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.66 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.66 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.66 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.73 
 
 
370 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.53 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.53 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.53 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.19 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.67 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.67 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  26.33 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.2 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.47 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.12 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.12 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  26.33 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.71 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  25 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  36.22 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
411 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1559  transposase for IS1663  25.18 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  23.81 
 
 
396 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.76 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2047  IS110 family transposase OrfB  32.2 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2203  IS110 family transposase orfb  32.2 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.44 
 
 
421 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.31 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.43 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.32 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  27.3 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.58 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.32 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  22.58 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.32 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  28.48 
 
 
418 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  29.66 
 
 
418 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  28.48 
 
 
394 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.34 
 
 
404 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.34 
 
 
404 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.34 
 
 
404 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.34 
 
 
404 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  26.99 
 
 
408 aa  59.3  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  30.26 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0148  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.4 
 
 
136 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  29.35 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.48 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.27 
 
 
393 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.13 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410361  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6871  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.13 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.04 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 
401 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  26.62 
 
 
385 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 
401 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.05 
 
 
338 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  27.9 
 
 
420 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  27.9 
 
 
420 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  27.9 
 
 
420 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  27.9 
 
 
420 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  27.9 
 
 
420 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  27.9 
 
 
420 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  26.7 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0485  putative transposase IS116/IS110/IS902  27.48 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0324291  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.4 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.4 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>