More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10140 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10140  oxidoreductase  100 
 
 		 340 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.3 
 
 		 336 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.69 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.69 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.9 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.39 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.93 
 
 		 336 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.66 
 
 		 337 aa  339  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.1 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.74 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.91 
 
 		 334 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.05 
 
 		 335 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.74 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.384866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.78 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.78 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.48 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.91 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.025164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  35.56 
 
 		 340 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  36.99 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 330 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  32.82 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  33.74 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  32.42 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  34.05 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  34.45 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  32.71 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  34.45 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  32.82 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  34.47 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  33.85 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.85 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  32.92 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  33.54 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.85 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  34.56 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  33.53 
 
 		 349 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  32.82 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  33.85 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  33.54 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  33.54 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  33.54 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  33.53 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  33.53 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  33.33 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  31.29 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  31.29 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.4 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  33.03 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  29.13 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.67 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  32.93 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  32.93 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  31.8 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.76 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 		 329 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  31.52 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  26.19 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.7 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6145  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.09 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804381  normal  0.0679863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  27.24 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>