154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0605 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  53.85 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  45.21 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  46.88 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  46.88 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  40.65 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  42.52 
 
 		 321 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  45.82 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  42.09 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  37.42 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  34.97 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  34.95 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  34.65 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  32.11 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  31.79 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  33 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  31.77 
 
 		 312 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  32.16 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  30.72 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  32.17 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  31.1 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  30.77 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  35.9 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  31.94 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  30.58 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  34.29 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  29.86 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  31.18 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  31.1 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  34.07 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  29.97 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  29.69 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  31.68 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  31.54 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  31.94 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  29.83 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  28.48 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  30.56 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  31.64 
 
 		 277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  30.33 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  30.92 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  28.42 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  28.42 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  32.29 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  28.42 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  28.42 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  28.42 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  28.42 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  31.34 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  31.1 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  28.07 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  29.68 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  31.1 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  28.42 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  28.42 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  31.1 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  28.42 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  29.03 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27908  predicted protein  28.78 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.789024  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  29.33 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  30.63 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  32.57 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  29.33 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  27.56 
 
 		 499 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  30.14 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  29.76 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  30.68 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  30.46 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  30.1 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  31.13 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  29.13 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  29.32 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  29.72 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  29.83 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  28.27 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  30.93 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  30.9 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06909  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997625  normal  0.453793 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  29.32 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  29.32 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  29.45 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  28.72 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  28.72 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  29.18 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  30.97 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  29.49 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  29.53 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  29.67 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  28.03 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49488  predicted protein  32.22 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  30.96 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  28.62 
 
 		 306 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  30.65 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  30.43 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  28.05 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  30.32 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  29.12 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  26.97 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>