More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0303 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 384 aa  762    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  50.28 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  42.17 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  39.52 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  42.38 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  37.88 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  36.16 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  36.74 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  37.03 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  37.35 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  38.32 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  37.35 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  38.18 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  37.54 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  36.51 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  35.94 
 
 		 346 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  36.09 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  43.43 
 
 		 256 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  34.88 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  35.58 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  37.05 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  31.91 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  33.77 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  33.93 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.91 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  33.54 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.33 
 
 		 334 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  33.33 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.04 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.14 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  32.69 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  35.28 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  31.4 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30.77 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  31.72 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  32.8 
 
 		 356 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30.21 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  32.8 
 
 		 356 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 335 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  29.68 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  37.71 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  34.07 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  33.64 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  30.49 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  30.49 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  30.49 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  32.36 
 
 		 325 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  28.78 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  30.46 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.15 
 
 		 357 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.26 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  31.41 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  32.66 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  30.84 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  28.02 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  29.32 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  30.09 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  30.09 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  31.3 
 
 		 650 aa  106  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 771 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  25.29 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 		 564 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.32 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  27.87 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  24.92 
 
 		 517 aa  99.8  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  27.54 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  27.54 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.92 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  27.21 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  27.54 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 773 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  26.58 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  32.88 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  28.09 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  26.6 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.97 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  30.18 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  33.51 
 
 		 182 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 775 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  27.24 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  29.18 
 
 		 221 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  29.18 
 
 		 221 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>