More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0721 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  87.08 
 
 
388 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  775    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  93.02 
 
 
387 aa  693    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  78.29 
 
 
387 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  77.52 
 
 
387 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  77.52 
 
 
387 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.97 
 
 
387 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  77 
 
 
387 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  77 
 
 
387 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.06 
 
 
387 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.54 
 
 
433 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.19 
 
 
387 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.06 
 
 
387 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.77 
 
 
387 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.98 
 
 
384 aa  584  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  73.9 
 
 
387 aa  580  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  73.9 
 
 
391 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  55.35 
 
 
381 aa  431  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.81 
 
 
381 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  55.08 
 
 
381 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.07 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  51.81 
 
 
396 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  49.32 
 
 
372 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  47.83 
 
 
372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  78.24 
 
 
219 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.28 
 
 
370 aa  348  9e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.81 
 
 
387 aa  347  2e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  46.2 
 
 
370 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.36 
 
 
368 aa  339  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  47.28 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  47.3 
 
 
372 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.1 
 
 
373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  47.55 
 
 
374 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.99 
 
 
369 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  47.83 
 
 
374 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  47.14 
 
 
369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  43.28 
 
 
378 aa  316  4e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  42.93 
 
 
374 aa  312  5.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.74 
 
 
374 aa  312  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  43.48 
 
 
376 aa  312  6.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  42.39 
 
 
373 aa  311  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.01 
 
 
381 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  47.12 
 
 
369 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.51 
 
 
378 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  45.97 
 
 
378 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  41.36 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  39.4 
 
 
383 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  40.84 
 
 
387 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.77 
 
 
377 aa  248  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.3 
 
 
377 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.63 
 
 
376 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  39.25 
 
 
375 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  36.94 
 
 
385 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  39.66 
 
 
352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  37.34 
 
 
388 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
378 aa  215  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.81 
 
 
376 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.34 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.34 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.07 
 
 
378 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.07 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.97 
 
 
382 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  70.83 
 
 
124 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.54 
 
 
482 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.54 
 
 
482 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  27.74 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  30.38 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.53 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.43 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.59 
 
 
487 aa  117  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.82 
 
 
485 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.15 
 
 
489 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.86 
 
 
488 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.94 
 
 
508 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.05 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.54 
 
 
486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.95 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  27.61 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.26 
 
 
488 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.93 
 
 
483 aa  113  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
491 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.98 
 
 
493 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.12 
 
 
488 aa  113  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
489 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.07 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.48 
 
 
488 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  36.29 
 
 
484 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.98 
 
 
481 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.16 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.48 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.8 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0489  IMP dehydrogenase  39.34 
 
 
497 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.08 
 
 
491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.63 
 
 
484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.1 
 
 
482 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.09 
 
 
498 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>