More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2324 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2324  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
399 aa  788    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0367  exonuclease VII, large subunit  69.51 
 
 
387 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  63.38 
 
 
385 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  56.68 
 
 
382 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1460  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.41 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01621  exonuclease VII, large subunit  53.19 
 
 
386 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.84 
 
 
414 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.84 
 
 
414 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.17 
 
 
393 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.5 
 
 
406 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.69 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.92 
 
 
406 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.49 
 
 
397 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.45 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.57 
 
 
401 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.75 
 
 
407 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.58 
 
 
448 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.57 
 
 
446 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.93 
 
 
458 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.66 
 
 
408 aa  176  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.82 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.71 
 
 
398 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.51 
 
 
467 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.54 
 
 
453 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.78 
 
 
392 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.68 
 
 
404 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.13 
 
 
403 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1037  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.96 
 
 
397 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0524439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.54 
 
 
452 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.92 
 
 
428 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.18 
 
 
452 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.18 
 
 
452 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.66 
 
 
459 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.75 
 
 
402 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.85 
 
 
452 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.74 
 
 
387 aa  168  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.21 
 
 
445 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.78 
 
 
452 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.51 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.1 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2552  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.86 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.52 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.28 
 
 
414 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31 
 
 
561 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.22 
 
 
510 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00935981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.47 
 
 
450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.22 
 
 
510 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0175948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.5 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2149  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2272  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00826344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1044  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000021456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.25 
 
 
458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.94 
 
 
452 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.94 
 
 
452 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.94 
 
 
452 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.94 
 
 
452 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0929  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
460 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.344174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.23 
 
 
469 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.94 
 
 
452 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.66 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.38 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1052  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.75 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.89 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.98 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.5 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.67 
 
 
471 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.15 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.99 
 
 
417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.26 
 
 
474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.79 
 
 
387 aa  163  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182071  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.8 
 
 
444 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.93 
 
 
447 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.64 
 
 
542 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.96 
 
 
451 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2527  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.25 
 
 
440 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.258922  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.64 
 
 
542 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.36 
 
 
407 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.67 
 
 
396 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.17 
 
 
460 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.77 
 
 
384 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
460 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.89 
 
 
460 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.5 
 
 
459 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.25 
 
 
407 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.32 
 
 
460 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.32 
 
 
460 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.82 
 
 
459 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.45 
 
 
439 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.11 
 
 
465 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.28 
 
 
388 aa  160  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.74 
 
 
388 aa  160  4e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.09 
 
 
460 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.67 
 
 
449 aa  160  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.68 
 
 
467 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.17 
 
 
400 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.24 
 
 
398 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.11 
 
 
475 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>