158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2968 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2968  chaperone protein HchA  100 
 
 		 290 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2046  chaperone protein HchA  47.81 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2506  chaperone protein HchA  46.13 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0351  chaperone protein HchA  44.04 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2746  chaperone protein HchA  46.32 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  normal  0.255888 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1684  ThiJ/PfpI domain protein  46.32 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000959624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2068  chaperone protein HchA  45.96 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000391461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1678  chaperone protein HchA  45.96 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1218  chaperone protein HchA  45.96 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00819366  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0916  chaperone protein HchA  45.96 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000778732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2198  chaperone protein HchA  45.96 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1576  chaperone protein HchA  44.2 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.44285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2246  chaperone protein HchA  43.56 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0574  chaperone protein HchA  43.88 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.683174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0588  chaperone protein HchA  43.88 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49710  chaperone protein HchA  46.21 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3049  chaperone protein HchA  43.86 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5029  chaperone protein HchA  43.37 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0646455  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5831  chaperone protein HchA  43.37 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4348  chaperone protein HchA  43.37 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01882  chaperone protein HchA  47.71 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.2 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  31.33 
 
 		 231 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00030  cysteine-type peptidase, putative  27.51 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  25.44 
 
 		 933 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3683  ThiJ/PfpI domain protein  29.29 
 
 		 232 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.5 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1896  ThiJ/PfpI domain protein  22.59 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.815712  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  26.42 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  28.28 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  25.95 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  26.45 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3191  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5033  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.62 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  25.56 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  25.71 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  27.97 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  26.89 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25350  putative intracellular protease/amidase  26.69 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.57 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  28.32 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  27.02 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  28.95 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  24.8 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  29.91 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  26.12 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  26.75 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  24.27 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.49 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  26.75 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  26.92 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  24.52 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  21.67 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  28.47 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  21.67 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  26.1 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0592  ThiJ/PfpI domain protein  27.73 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.53 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1831  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.57 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.39 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  28.04 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3480  ThiJ/PfpI  23.33 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.782484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  25.32 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  25.32 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.53 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.27 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.45 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.42 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  25.32 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.64 
 
 		 224 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  25.74 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.74 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  24.9 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  23.58 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  24.49 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.64 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  25.44 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0621  ThiJ/PfpI domain protein  24 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121561 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  25 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  24.46 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.19 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.25 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.67 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  22 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  24.15 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  28.24 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.24 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.25 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2844  ThiJ/PfpI  23.73 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  22.54 
 
 		 229 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  22.78 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  22.82 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.82 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  21.72 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  28.57 
 
 		 166 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  26.17 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  23.93 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.07 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  24.46 
 
 		 220 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>