More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1982 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  54.26 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  55.26 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  53.04 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  55.75 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  48.84 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  56.52 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  55.75 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  54.78 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  57.45 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  42.19 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  42.19 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  47.54 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  42.19 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  47.5 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  45.53 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>