31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3997 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  100 
 
 		 359 aa  721    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  55.43 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  53.28 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  55.15 
 
 		 398 aa  338  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  52.12 
 
 		 350 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  50 
 
 		 353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  53.04 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  48.59 
 
 		 353 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  50.79 
 
 		 363 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  47.61 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  45.76 
 
 		 346 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  48.45 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  44.16 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  43.54 
 
 		 357 aa  252  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  34.62 
 
 		 594 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  34.18 
 
 		 590 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  34.08 
 
 		 575 aa  192  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  31.56 
 
 		 587 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  29.41 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  37.5 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  30.58 
 
 		 453 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  26.57 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  29.3 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  23.2 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  21.8 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  21.9 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  23.08 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  21.25 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  24.19 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  23.84 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>