More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2723 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1215  glucose-6-phosphate isomerase  70.06 
 
 		 501 aa  677    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0709148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2723  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 500 aa  1001    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1809  glucose-6-phosphate isomerase  63.4 
 
 		 507 aa  604  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.850311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 540 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  45.71 
 
 		 615 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  45 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  41.75 
 
 		 548 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1950  glucose-6-phosphate isomerase  43.77 
 
 		 533 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.0244382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  43.91 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2736  glucose-6-phosphate isomerase  42 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  43.94 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  43.02 
 
 		 537 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  43.91 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  43.91 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 532 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 		 542 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  43.31 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  40.63 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  43.31 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1394  glucose-6-phosphate isomerase  41.62 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  38.35 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00687  glucose-6-phosphate isomerase  44.29 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1776  glucose-6-phosphate isomerase  42.75 
 
 		 533 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.243279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  39.37 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  44.05 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  40.58 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  41.18 
 
 		 545 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  40.26 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  39.55 
 
 		 548 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  45.36 
 
 		 552 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  41.96 
 
 		 550 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  38.96 
 
 		 559 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  41.97 
 
 		 534 aa  362  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  39.18 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  41.79 
 
 		 540 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 538 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  41.06 
 
 		 540 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  39.06 
 
 		 548 aa  359  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 531 aa  358  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  40.43 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  38.39 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 538 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  40.43 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  43.61 
 
 		 547 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  39.56 
 
 		 541 aa  356  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  37.57 
 
 		 548 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 525 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  40.47 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  37.83 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  38.16 
 
 		 554 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  37.45 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  39.96 
 
 		 541 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  37.64 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  40.37 
 
 		 547 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  39.08 
 
 		 549 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  40.11 
 
 		 547 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  36.99 
 
 		 545 aa  352  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  37.45 
 
 		 545 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  37.78 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  39.33 
 
 		 560 aa  352  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  40.27 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0200  glucose-6-phosphate isomerase  42.74 
 
 		 502 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.525891  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  39.33 
 
 		 539 aa  350  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  39.25 
 
 		 549 aa  349  7e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  41.33 
 
 		 545 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  37.41 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 549 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  39.07 
 
 		 549 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  39.07 
 
 		 549 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  42.05 
 
 		 522 aa  347  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0176  glucose-6-phosphate isomerase  42.63 
 
 		 502 aa  347  4e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  36.19 
 
 		 547 aa  346  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  38.97 
 
 		 541 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  38.78 
 
 		 541 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  36.72 
 
 		 553 aa  346  7e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  41.11 
 
 		 543 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  42.59 
 
 		 540 aa  345  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  42.42 
 
 		 545 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  38.88 
 
 		 549 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  36.82 
 
 		 548 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  40.51 
 
 		 539 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  38.88 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  38.88 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  37.03 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  38.69 
 
 		 549 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  37.94 
 
 		 549 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  37.74 
 
 		 545 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  38.5 
 
 		 549 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>