More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1127 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  67.17 
 
 		 538 aa  713    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  66.73 
 
 		 520 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  62.22 
 
 		 540 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 522 aa  1062    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  76.39 
 
 		 525 aa  812    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  62.96 
 
 		 545 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  72.47 
 
 		 944 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  62.41 
 
 		 545 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  75 
 
 		 520 aa  763    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  70.91 
 
 		 532 aa  739    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  78.12 
 
 		 521 aa  815    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  68.43 
 
 		 538 aa  724    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 541 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 548 aa  490  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 649 aa  490  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 		 541 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  50.64 
 
 		 543 aa  487  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  48.72 
 
 		 549 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 545 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 615 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84923  phosphoglucoisomerase  49.72 
 
 		 553 aa  478  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  47.53 
 
 		 550 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  46.96 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 556 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  47.96 
 
 		 548 aa  478  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 556 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 540 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 540 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 547 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  47.85 
 
 		 545 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  49.53 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  47.64 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  49 
 
 		 569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  46.38 
 
 		 562 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  46.57 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  47.01 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  51.72 
 
 		 542 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  49.26 
 
 		 546 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  47.25 
 
 		 552 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  45.96 
 
 		 550 aa  465  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  44.91 
 
 		 567 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 550 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  49.07 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  46.45 
 
 		 545 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 550 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  44.75 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  46.3 
 
 		 548 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  45.82 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  45.96 
 
 		 550 aa  465  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 541 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 551 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 547 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  50.47 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  48.96 
 
 		 541 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  48.33 
 
 		 550 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 543 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  46.6 
 
 		 531 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  48.57 
 
 		 540 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  46.27 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 547 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  47.35 
 
 		 541 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 549 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  48.07 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  47.54 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  45.72 
 
 		 545 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 549 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  45.67 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  47.21 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  48.71 
 
 		 537 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  47.34 
 
 		 549 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>