More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5674 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  64.46 
 
 		 538 aa  682    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 540 aa  1099    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  62.22 
 
 		 522 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  63.21 
 
 		 525 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  65.34 
 
 		 538 aa  691    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  62.78 
 
 		 532 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  61.67 
 
 		 521 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  60.45 
 
 		 520 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  60.22 
 
 		 944 aa  591  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  60.53 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  56.42 
 
 		 545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  57.73 
 
 		 545 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 547 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  45.86 
 
 		 541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  45.76 
 
 		 548 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  47.74 
 
 		 547 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  43.96 
 
 		 552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  48.33 
 
 		 541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  44.72 
 
 		 550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  44.12 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  46.97 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  44.72 
 
 		 550 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  44.12 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  44.95 
 
 		 554 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  43.94 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  43.49 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  44.12 
 
 		 554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  44.16 
 
 		 554 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  44.73 
 
 		 546 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 548 aa  444  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  47.07 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  47.4 
 
 		 542 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  45.11 
 
 		 543 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  44.85 
 
 		 550 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  44.71 
 
 		 549 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  44.96 
 
 		 545 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  46.41 
 
 		 543 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  45.59 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  44.16 
 
 		 549 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  43.36 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  43.8 
 
 		 549 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  43.71 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  46 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  44.08 
 
 		 550 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  46.32 
 
 		 569 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  47.75 
 
 		 649 aa  435  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  43.8 
 
 		 549 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 549 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  44.5 
 
 		 545 aa  435  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  47.12 
 
 		 549 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  43.35 
 
 		 554 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  44.89 
 
 		 552 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  43.71 
 
 		 549 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  43.98 
 
 		 549 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  45.28 
 
 		 550 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  42.88 
 
 		 548 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 549 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  41.56 
 
 		 567 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 549 aa  435  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 549 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  44.36 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 545 aa  435  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 549 aa  435  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  45.34 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  44.46 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  44.38 
 
 		 548 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 615 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 540 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  42.88 
 
 		 549 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 545 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 545 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  43.07 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  43.88 
 
 		 547 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  42.88 
 
 		 549 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  43.51 
 
 		 562 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 554 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  42.7 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  43.7 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  42.7 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  44.12 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  42.7 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  43.22 
 
 		 549 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 547 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  44.01 
 
 		 545 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  42.01 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  43.43 
 
 		 560 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  43.92 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>