More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3385 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  63.87 
 
 		 520 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 545 aa  1113    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  62.41 
 
 		 522 aa  650    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  60.93 
 
 		 538 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  61.15 
 
 		 525 aa  648    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  69.81 
 
 		 545 aa  752    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  60.93 
 
 		 538 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  63.34 
 
 		 532 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  61.69 
 
 		 521 aa  634  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  60.62 
 
 		 520 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  60.55 
 
 		 944 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  56.73 
 
 		 540 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  52.17 
 
 		 543 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  51.64 
 
 		 541 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  51.82 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  50.54 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 		 549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  52.1 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 548 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  52.1 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  52.1 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  52.93 
 
 		 549 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  53.1 
 
 		 547 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  52.01 
 
 		 615 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  51.55 
 
 		 556 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  52.1 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  51.55 
 
 		 540 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  49.28 
 
 		 545 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  51.92 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 551 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  51.37 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  52.1 
 
 		 540 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  51.92 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  51.46 
 
 		 556 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  49.09 
 
 		 545 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  49.09 
 
 		 545 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  49.37 
 
 		 548 aa  508  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  51.83 
 
 		 540 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  49.28 
 
 		 545 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  47.56 
 
 		 550 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  48.91 
 
 		 545 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 		 649 aa  507  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  51.64 
 
 		 556 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  47.48 
 
 		 548 aa  505  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  51.64 
 
 		 556 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  53 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  48.64 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  50.27 
 
 		 548 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  48.45 
 
 		 547 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 545 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  48.73 
 
 		 562 aa  500  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  48.73 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  48.1 
 
 		 550 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 		 569 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 545 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  46.68 
 
 		 549 aa  495  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  47.2 
 
 		 550 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 548 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  47.74 
 
 		 550 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  50.45 
 
 		 556 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  51.45 
 
 		 540 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 548 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  51.74 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 548 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  46.32 
 
 		 567 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  48.19 
 
 		 545 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  48.01 
 
 		 545 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  49 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  47.25 
 
 		 550 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 554 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  47.94 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  48.45 
 
 		 554 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.12 
 
 		 549 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  49 
 
 		 554 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 554 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  47.94 
 
 		 549 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  48.38 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 547 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  51.79 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  50.27 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  48.64 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  52.25 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 547 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  48.63 
 
 		 560 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  47.58 
 
 		 548 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 545 aa  487  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  46.65 
 
 		 549 aa  488  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 541 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  48.45 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  47.83 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  47.41 
 
 		 552 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  46.98 
 
 		 549 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>